آزمایشات مولکولی بیش از دو دهه می باشد که وارد آزمایشگاه های تشخیص طبی شده است و توانسته اند پاسخگوی بسیاری از معضلات تشخیصی بیماری های انسانی باشند. به همین لحاظ شاهد بوده ایم که حجم گسترده ای از تحقیقات در این حیطه صورت گرفته و شرکت های تجاری سرمایه گذاری عظیمی را به واسطه درخواست ها در این حوزه انجام داده اند. همچنان که حساسیت و ویژگی تست از اهمیت به سزایی برخوردار است، استاندار سازی و تکرار پذیر نمودن نتایج هر یک از تست های مولکولی نیز هیچگاه تا به این اندازه مکتوب نشده بود. معهذا مشاهده می شود که تعداد قابل توجهی از نتایج منفی گزارش شده مورد رضایت پزشکان نمی باشد. در این مقاله سعی شده علل این مهم  و نقش کنترل ها به ویژه کنترل داخلی بررسی شود.