بیماری های عفونی همچنان یک تهدید جهانی محسوب که سالانه افراد زیادی به این بیماری همه گیر مبتلا می شوند. شناخت بهتر چگونگی بیماری زایی باکتری ها، ویروس ها، قارچ ها و انگل ها به همراه تشخیص سریع و درمان عفونت های انسانی برای بهبود نتایج بیماری های عفونی در سراسر جهان ضروری است. در بسیاری از ژنوم باکتری ها و آرکئی باکتر ها، توانستند تناوب‌ های کوتاهِ پالیندرومِ فاصله‌دارِ منظمِ خوشه‌ ای که با عنوان سیستم کریسپر یا سیستم کریسپر مرتبط با ژن  casاست را شناسایی کنند. نقش فیزیولوژیکی این سیستم در پروکاریوت ها با عنوان سیستم ایمنی دفاعی در مقابل مهاجم خارجی، تشخیص داده شده است. از عناصر اصلی این سیستم دفاعی پروکاریوتی، RNA های راهنما کوچک است که نوکلئاز ها را به سوی اسید نوکلئیک های مکمل خود در ویروس ها و پلاسمید ها هدایت می کنند. در حال حاضر فناوری CRISPR-Cas9 به طور معمول برای پیشرفت در علم پزشکی بیولوژیکی در حوزه ویرایش کارآمد ژن ها، نقش به سزایی دارند.
در این مقاله مروری، به طور خلاصه زیست شناسی و مکانیسم سیستم های CRISPR-Cas را مورد بررسی قرار می دهیم و همچنین کاربردهای جدید را برای ارزیابی این سیستم از جمله: ارتباط بین میزبان و پاتوژن، تشخیص دقیق، پیشگیری و درمان بیماری های عفونی را مورد بحث قرار خواهیم داد.