طیف ارگانیسمهایی که قادر به ایجاد عفونتهای تهدید کننده در بیماران گیرنده پیوند عضو هستند بسیار گسترده است و در یک سیستم طبقه بندی ساده عبارتند از: پاتوژن های حقیقی، ارگانیسمهایی که گاهی اوقات پاتوژن هستند و ارگانیسمهای غیر بیماری زا. پاتوژن های حقیقی شامل آنفلوآنزا، طاعون بوبونیک یا طاعون خیارکی، آبله و غیره میباشند که سموم مختلفی تولید میکنند و به سطوح بافتی آسیب میرسانند و ایمنی اختصاصی یا درمان ضد میکروبی مؤثر برای کنترل آنها ضروری است. برخی دیگر از این پاتوژن ها به طور معمول بر روی سطوح مخاطی پوست بدون تأثیر بالینی ساکن هستند. آسیب به این سطوح دسترسی این ارگانیسمها را به مکانهای آسیب پذیر در برابر عفونت تهاجمی (مانند پریتونیت پس از سوراخ شدن کولون) فراهم میکند. غیر بیماری زاها آن دسته از ساپروفیت هایی هستند که همه جا در محیط حضور دارند و با مکانیسمهای ایمنی ذاتی کنترل میشوند و فقط در افراد دارای نقص ایمنی قابل توجه (مانند گونههای آسپرژیلوس، پنموسیستیس جیرووسی، زیگومیست ها و انواع دیگرمیکروب ها) ایجاد بیماری میکنند. اصطلاح عفونت فرصت طلب به یک عفونت تهاجمی ناشی از یک غیر بیماری زا یا به عفونت ناشی از ارگانیسمی اطلاق میشود که باعث عفونت بی اهمیت در میزبان عادی اما عفونت تهدید کننده زندگی در فرد دارای نقص ایمنی میشود (مانند واژینیت کاندیدیایی در مقابل کاندیدیازیس منتشر). بیماران پیوندی با تقویت یک سندرم بالینی خاص که توسط حالت سرکوب سیستم ایمنی ایجاد میشود در معرض خطر هر سه دسته عفونت هستند. به طور کلی عفونتهای قارچی که در بیمار پیوندی ایجاد میشود توسط دو دسته از میکروارگانیسمهای فوق یعنی ارگانیسمهای فرصت طلب و غیر بیماری زا ایجاد میشوند و به صورت کاربردی میتوان آنها را به سه دسته کلی تقسیم کرد: میکوزهای سیستمیک بومی، محدود از نظر جغرافیایی (ناشی از بلاستومایسس درماتیتیدیس، کوکسیدیوئیدس ایمیتیس، هیستوپلاسما کپسولاتوم و سایرین). این میکرو ارگانیسمها دارای تعدادی ویژگی مشترک هستند: آنها در الگوی رشد خود دو شکلی هستند، با فرم میسلیوم یا کپک موجود در خاک مناطق بومی، که در این حالت هاگ تولید میکنند که برای انسان مسری است. استنشاق این عوامل عفونی و رسوب آنها در دستگاه تنفسی و سپس تبدیل کنیدی ها به شکل مخمر مهاجم باعث شروع فرآیند عفونی میشود. عفونتهای قارچی فرصت طلب، شایعترین علل عفونت قارچی مهاجم در گیرنده پیوند، ارگانیسمهای معمولی (کومنسال) موجود در سطوح مخاطی بدن (گونههای کاندیدا) و ارگانیسمهای ساپروفیت هستند که در همه جا در محیط وجود دارند (مانند آسپرژیلوس، کریپتوکوکوس و زیگومیست ها). عواملی که به رشد بیش از حد این میکروارگانیسمها کمک میکنند عبارتند از کاهش نظارت ایمنی به دلیل سرکوب سیستم ایمنی یا نوتروپنی، دیابت شیرین و سایر بیماریهای غدد درون ریز و حذف فلور میکروبی رقیب با استفاده از آنتی بیوتیک های با طیف اثر گسترده. قارچهای جدید و نوپدید، ماهیت گونههای قارچی عامل عفونت تهاجمی در بیمار پیوندی در حال تغییر قابل توجه است. اگر چه همچنان کاندیدا آلبیکنس حساس به فلوکونازول، آسپرژیلوس فومیگاتوس و کریپتوکوکوس نئوفرمنس شایعترین علل عفونت قارچی مهاجم در گیرندگان پیوند عضو جامد هستند، 2 تا 10 درصد از عفونتهای قارچی مهاجم امروزه توسط ارگانیسمهایی مانند کاندیدای مقاوم به فلوکونازول (شامل سویههای آلبیکنس و غیر آلبیکنس)، سدوسپوریوم، تریکوسپورون، فوزاریوم و سایر ارگانیسمهای غیرمعمول ایجاد میشوند. فشارهای انتخابی استراتژیهای پیشگیری ضد قارچی، افزایش قدرت و توان برنامههای مدرن سرکوب کننده سیستم ایمنی و افزایش مواجهه (هم در بیمارستان و هم در جامعه) بدون شک به اهمیت روز افزون این دسته از عفونتها کمک کرده است. آنچه که اهمیت ویژهای دارد این است که بسیاری از این ارگانیسمها به آمفوتریسین B واکنش ضعیفی نشان میدهند و به وریکونازول یا برخی درمانهای ابتکاری دیگر نیاز دارند. این گروه از عفونتها تقریباً مطمئناً در چند سال آینده اهمیت خود را افزایش خواهند داد و نه تنها به درمانهای جدید، بلکه رویکردهای تشخیصی جدید نیز نیاز دارند.